La misión del LAMYC es conocer y estudiar los procesos socio ecológicos costeros, principalmente los que se dan en las entidades federativas que conforman la Península de Yucatán. Con el fin de, en la medida de lo posible, contribuir con el intercambio de ideas y la transferencia de conocimiento, a que los sistemas socio ecológicos de la región, sean mejores escenarios para vivir y convivir, de frente al futuro, y la sostenibilidad de los recursos naturales, con las poblaciones humanas.
La misión del LAMYC, es amplia, ya que los procesos que encontramos, son diversos, implican diferentes disciplinas de estudio, que implican a las comunidades asentadas en la costa, cómo llegaron, las actividades económicas que realizan, sus estrategias de supervivencia, sus costumbres, sus formas de enfrentar los problemas, cómo se vinculan con las comunidades de tierra adentro, y otros.
La visión del LAMYC, es analizar las costas y los mares peninsulares (Caribe, Golfo de México, Atlántico), desde una perspectiva multi y transdisciplinaria, en el intento de entender y comprender lo que sucede en cuestiones de pesca artesanal, protección y conservación de reservas naturales, la emergencia de las actividades turísticas como alternativa económica, la contribución que se pueda aportar para enfrentar problemas ambientales y biológicos propios de las condiciones actuales.
Por tales motivos, la visión del LAMYC, imbrica diferentes disciplinas de formación, que recrean una visión diversa y polifacética, con formaciones tales como la antropología, biología, biología marina, turismo, ingeniería, energía, arquitectura, medicina, psicología, y otras.
En el LAMYC, consideramos prioritarias las experiencias que enriquezcan la comprensión y el manejo del territorio regional, por lo que se considera importantísima la vinculación académica con instituciones no solo locales, sino nacionales y extranjeras. Valoramos la transferencia del conocimiento a través de la formación de recursos humanos, mediante la impartición de cursos, dirección de tesis de diferentes grados; mantenemos las puertas abiertas para recibir estudiantes y profesores para realizar estancias de investigación en el laboratorio, de incursionar en otras maneras de publicar y de difundir la ciencia del laboratorio, no solamente en medios impresos como revistas y libros, sino que participando en foros, congresos y con la realización de productos en soporte digital, como son los documentales científicos que han sido producidos, uniendo esfuerzos con otros laboratorios y departamentos pares en otras instituciones regionales, nacionales e internacionales.
Las amenazas que sufre el LAMYC, son los recortes de presupuesto a la investigación, las limitaciones que se implementan para la adquisición de equipo, y la tramitología administrativa que se hace más gruesa con los años.
La falta de reconocimiento por los esfuerzos y los productos de investigación, en redes del conocimiento, que contradice los discursos y programas de las autoridades científicas y de gobierno..
El LAMYC tiene como principales fortalezas la basta trayectoria de experiencia en antropología costera y marítima, el know how de estudios sociales que complementan de forma necesaria la parte biológica y natural.
Así mismo, la diversificación en cuanto a vinculación para colaboración, intervención y apoyo, de instituciones regionales e internacionales, de los distintos sectores, académico, públicos, del sector social, y privado.
Las debilidades del LAMYC, son básicamente, la participación fragmentada en diversas actividades y proyectos, que resultan atractivos para colaborar, es necesario acotar y concentrar esfuerzos para mejores resultados de esfuerzos colectivos.
Las oportunidades del LAMYC, son ricas en cuanto a las invitaciones que se reciben para participar con pares de otras disciplinas, departamentos, universidades, y asociaciones civiles, por motivos de la formación y experiencia acumulada a través de los años, combinando lenguajes vernáculos y científicos (maya, inglés, francés y otras lenguas).